Basée à Hyères et armée d'hélicoptères Lynx WG13, la 31e flottille d'hélicoptères embarqués (31F) est spécialisée dans la lutte anti-sous-marine. C'est la première flottille d'hélicoptères de l'aéronavale, créée le 1er août 1956 en Algérie, elle était équipée dans un premier temps d'hélicoptères H21C "Banane", qui effectuaient des missions de transport et d'assaut. Après quelques embarquements sur les porte-avions Arromanches, Clemenceau puis Foch, et deux missions dans le Pacifique, elle commence à se spécialiser dans la lutte anti-sous-marine sur HSS à partir de 1961. L'arrivée des Lynx en 1978 confirmera cette vocation ASM. Elle fournira, et fournit encore de nos jours, des détachements au profit des bâtiments porte-hélicoptères basés à Toulon. Ses appareils, embarqués principalement sur les frégates type Georges Leygues, ont participé à la guerre du Golfe (1991), aux divers conflits en Somalie, Erytrée, Yougoslavie, ainsi qu'à l'opération Héracles (Afghanistan) au coté du porte-avions Charles de Gaulle. Son emblème est un Pégase blanc - un cheval ailé, symbole que les américains ont choisi pour leurs propres H21, surnommés "work-horse" (cheval de trait) - sur Croix d'Agadès, parce que la flottille a vu le jour en Afrique du Nord. Au 1er juillet 2006, la 31F comptait 128 marins, 9 hélicoptères Lynx et armait 4 frégates anti-sous-marines type F70 (Jean de Vienne, Dupleix, Montcalm, et La Motte-Piquet). La mission principale de la 31F reste la lutte anti-sous-marine. Ses équipages sont également amenés à remplir des missions de sauvetage en mer, à l’image du 21 mars 2006 dans le golfe d’Oman, où un hélicoptère Lynx de la 31F a participé à l’évacuation d’un membre d’équipage d’un porte-containers panaméen en feu. En 2010, compte tenu des travaux d'organisation de l'aéronautique navale, en préparation de l'arrivée de l'hélicoptère NH 90 dans la marine, l'état-major de la marine décide la mise en sommeil de la 31F à partir du 25 juin 2010. Les détachements d'hélicoptères Lynx au profit de la force d'action navale seront alors constitués au sein de la flottille 34F. La flottille 31F a pour ville marraine Banyuls-sur-mer (66) depuis le 23 juin 2009.
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